Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pja2Q80U04 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pja2Q80U04 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms