Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sgo2Q7TSY8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgo2Q7TSY8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms