Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clec18aQ7TSQ1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clec18aQ7TSQ1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clec18aQ7TSQ1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clec18aQ7TSQ1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clec18aQ7TSQ1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clec18aQ7TSQ1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clec18aQ7TSQ1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clec18aQ7TSQ1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clec18aQ7TSQ1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clec18aQ7TSQ1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clec18aQ7TSQ1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clec18aQ7TSQ1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clec18aQ7TSQ1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clec18aQ7TSQ1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clec18aQ7TSQ1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clec18aQ7TSQ1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clec18aQ7TSQ1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clec18aQ7TSQ1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clec18aQ7TSQ1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clec18aQ7TSQ1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Clec18aQ7TSQ1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Clec18aQ7TSQ1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Clec18aQ7TSQ1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Clec18aQ7TSQ1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Clec18aQ7TSQ1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Clec18aQ7TSQ1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Clec18aQ7TSQ1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Clec18aQ7TSQ1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clec18aQ7TSQ1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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