Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI0

Znf12, Zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf12Q7TSI0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Znf12Q7TSI0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf12Q7TSI0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf12Q7TSI0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf12Q7TSI0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf12Q7TSI0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf12Q7TSI0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf12Q7TSI0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf12Q7TSI0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf12Q7TSI0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf12Q7TSI0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf12Q7TSI0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf12Q7TSI0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf12Q7TSI0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf12Q7TSI0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf12Q7TSI0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf12Q7TSI0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf12Q7TSI0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf12Q7TSI0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf12Q7TSI0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf12Q7TSI0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf12Q7TSI0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf12Q7TSI0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf12Q7TSI0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf12Q7TSI0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf12Q7TSI0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf12Q7TSI0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf12Q7TSI0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf12Q7TSI0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf12Q7TSI0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf12Q7TSI0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf12Q7TSI0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms