Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ckap2lQ7TS74 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms