Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ33

Rgmb, RGM domain family member B, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmbQ7TQ33 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RgmbQ7TQ33 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RgmbQ7TQ33 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RgmbQ7TQ33 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RgmbQ7TQ33 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RgmbQ7TQ33 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RgmbQ7TQ33 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RgmbQ7TQ33 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RgmbQ7TQ33 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RgmbQ7TQ33 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RgmbQ7TQ33 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RgmbQ7TQ33 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RgmbQ7TQ33 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RgmbQ7TQ33 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RgmbQ7TQ33 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RgmbQ7TQ33 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RgmbQ7TQ33 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RgmbQ7TQ33 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RgmbQ7TQ33 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RgmbQ7TQ33 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RgmbQ7TQ33 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RgmbQ7TQ33 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RgmbQ7TQ33 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RgmbQ7TQ33 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms