Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms