Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp397Q7TNK4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms