Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms