Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf2Q7TMI3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms