Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dsg4Q7TMD7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg4Q7TMD7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 218.8 ms