Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Scn4bQ7M729 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn4bQ7M729 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn4bQ7M729 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn4bQ7M729 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Scn4bQ7M729 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Scn4bQ7M729 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Scn4bQ7M729 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Scn4bQ7M729 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Scn4bQ7M729 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn4bQ7M729 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn4bQ7M729 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Scn4bQ7M729 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Scn4bQ7M729 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scn4bQ7M729 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Scn4bQ7M729 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Scn4bQ7M729 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn4bQ7M729 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn4bQ7M729 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Scn4bQ7M729 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Scn4bQ7M729 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Scn4bQ7M729 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Scn4bQ7M729 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Scn4bQ7M729 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn4bQ7M729 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Scn4bQ7M729 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Scn4bQ7M729 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn4bQ7M729 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn4bQ7M729 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn4bQ7M729 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn4bQ7M729 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn4bQ7M729 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn4bQ7M729 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn4bQ7M729 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn4bQ7M729 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn4bQ7M729 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn4bQ7M729 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn4bQ7M729 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn4bQ7M729 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn4bQ7M729 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn4bQ7M729 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn4bQ7M729 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn4bQ7M729 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn4bQ7M729 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn4bQ7M729 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn4bQ7M729 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn4bQ7M729 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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