Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed3Q78IS1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms