Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd3eapQ76KJ5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd3eapQ76KJ5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms