Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nme8Q715T0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms