Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nemp1Q6ZQE4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nemp1Q6ZQE4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms