Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Efr3bQ6ZQ18 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Efr3bQ6ZQ18 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Efr3bQ6ZQ18 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Efr3bQ6ZQ18 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efr3bQ6ZQ18 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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