Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Glis3Q6XP49 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Glis3Q6XP49 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Glis3Q6XP49 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Glis3Q6XP49 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Glis3Q6XP49 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Glis3Q6XP49 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Glis3Q6XP49 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Glis3Q6XP49 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Glis3Q6XP49 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Glis3Q6XP49 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Glis3Q6XP49 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Glis3Q6XP49 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Glis3Q6XP49 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Glis3Q6XP49 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Glis3Q6XP49 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Glis3Q6XP49 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Glis3Q6XP49 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Glis3Q6XP49 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Glis3Q6XP49 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Glis3Q6XP49 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Glis3Q6XP49 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Glis3Q6XP49 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Glis3Q6XP49 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Glis3Q6XP49 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Glis3Q6XP49 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Glis3Q6XP49 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Glis3Q6XP49 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms