Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl3Q6W5C0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.1 ms