Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms