Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms