Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp8b3Q6UQ17 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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