Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms