Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms