Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms