Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms