Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGE7

Slc6a7, Sodium-dependent proline transporter, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a7Q6PGE7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a7Q6PGE7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms