Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFQ7

Rasa4, Ras GTPase-activating protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa4Q6PFQ7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rasa4Q6PFQ7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rasa4Q6PFQ7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms