Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms