Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CtifQ6PEE2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms