Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM2

Srsf1, Serine/arginine-rich splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf1Q6PDM2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf1Q6PDM2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf1Q6PDM2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms