Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam222bQ6P539 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam222bQ6P539 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam222bQ6P539 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms