Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms