Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms