Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms