Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms