Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q6DFW0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6DFW0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6DFW0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms