Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntn4Q69Z26 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms