Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sbno1Q689Z5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms