Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf2Q64705 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms