Protein–RNA interactions for Protein: Q64522

Hist2h2ab, Histone H2A type 2-B, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2abQ64522 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist2h2abQ64522 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6.7 ms