Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms