Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn13Q64512 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ptpn13Q64512 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ptpn13Q64512 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms