Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

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Length 994 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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Clcn1Q64347 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clcn1Q64347 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clcn1Q64347 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clcn1Q64347 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clcn1Q64347 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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Clcn1Q64347 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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Clcn1Q64347 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clcn1Q64347 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcn1Q64347 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcn1Q64347 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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Clcn1Q64347 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcn1Q64347 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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Clcn1Q64347 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcn1Q64347 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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Clcn1Q64347 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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Clcn1Q64347 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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Clcn1Q64347 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Clcn1Q64347 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Clcn1Q64347 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Clcn1Q64347 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Clcn1Q64347 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Clcn1Q64347 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Clcn1Q64347 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms