Protein–RNA interactions for Protein: Q64318

Zeb1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb1Q64318 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zeb1Q64318 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Zeb1Q64318 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Zeb1Q64318 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Zeb1Q64318 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms