Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt12Q64291 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms