Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
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