Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Defa17Q64016 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Defa17Q64016 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms