Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PatjQ63ZW7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PatjQ63ZW7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PatjQ63ZW7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PatjQ63ZW7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PatjQ63ZW7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PatjQ63ZW7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PatjQ63ZW7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PatjQ63ZW7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PatjQ63ZW7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PatjQ63ZW7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PatjQ63ZW7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PatjQ63ZW7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PatjQ63ZW7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PatjQ63ZW7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PatjQ63ZW7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PatjQ63ZW7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PatjQ63ZW7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PatjQ63ZW7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PatjQ63ZW7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PatjQ63ZW7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PatjQ63ZW7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PatjQ63ZW7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PatjQ63ZW7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PatjQ63ZW7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PatjQ63ZW7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PatjQ63ZW7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms