Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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Znf260Q62513 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Znf260Q62513 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Znf260Q62513 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Znf260Q62513 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Znf260Q62513 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Znf260Q62513 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Znf260Q62513 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Znf260Q62513 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms